對臨床組織樣本進(jìn)行研究，尋找**標(biāo)記，是蛋白質(zhì)組研究的重要方向之一。但臨床樣本都是各種細(xì)胞或組織混雜，而且狀態(tài)不一。如腫瘤組織中，發(fā)生癌變的往往是上皮類細(xì)胞，而這類細(xì)胞在腫瘤中總是與血管、基質(zhì)細(xì)胞等混雜。所以，常規(guī)采用的癌和癌旁組織或腫瘤與正常組織進(jìn)行差異比較，實(shí)際上是多種細(xì)胞甚至組織蛋白質(zhì)組混合物的比較。而蛋白質(zhì)組研究需要的通常是單一的細(xì)胞類型。*近在組織水平上的蛋白質(zhì)組樣品制備方面也有新的進(jìn)展，如采用激光捕獲微解剖(LaserCapture Microdissection, LCM) 方法分離癌變上皮類細(xì)胞。