一項正在進行的監測廢水中是否存在SARS-CoV-2并且有效地預測了美國圣地亞哥市COVID-19病例的后續激增的計劃已經擴大到檢測猴痘的存在。

自從2022年5月下旬美國加州出現**例猴痘確診病例以來，該州和美國各地的報告病例穩步上升，目前圣地亞哥縣已達近100例，加州已超過1300例。

2022年8月1日，該州宣布進入公共衛生緊急狀態；**天，圣地亞哥縣也跟進。2022年8月4日，美國宣布進入聯邦公共衛生緊急狀態，國內范圍內報告的病例超過7000例。這是自2001年以來的第五次國家緊急狀態。美國國內仍然處于冠狀病毒大流行的緊急狀態。

論文通訊作者、加州大學圣地亞哥分校教授兼微生物組**中心主任Rob Knight博士說，對猴痘病毒的監測和測試是目前針對SARS-CoV-2的廢水監測計劃的一個相對簡單的附加項目。

但有一個轉折。他說，“這與SARS-CoV-2 qPCR監測的過程相同，只是我們在測試一種不同的病毒。猴痘病毒是一種DNA病毒，所以我們為SARS-CoV-2（一種RNA病毒）優化的過程效果如此之好，這有點令人驚訝。”

研究人員在5月開始試驗他們的測試對兩種病毒類型都有效的可能性，并在6月初開始監測來自為220萬圣地亞哥人服務的諾馬角處理廠（Point Loma treatment plant）的廢水中是否存在猴痘病毒。

**個陽性指標發生在2022年7月10日，其水平接近檢測極限：每升廢水中有10565.54個病毒拷貝。此后，水平急劇上升，接著略有上升和下降，但有上升的趨勢，目前在2022年8月2日達到每升廢水189309.81個病毒拷貝的高點。

Knight說，監測廢水中的猴痘病毒載量水平是否能預測未來的感染或病例率，還有待觀察。他說，“我們還不知道這些數據是否會像COVID-19那樣預測病例的激增。這取決于這種病毒何時從體內脫落以及導致人們尋求**的癥狀有多嚴重。原則上，這對每種病毒都是不同的，盡管在實踐中，廢水似乎可以預測多種病毒。”

這種監測系統還沒有建立起對猴痘病毒基因組的測序，這是檢測新出現的變體的必要條件。但是，總體來說，Knight說，“DNA病毒的進化比RNA病毒慢得多，所以我們不會期望變體的出現和傳播那么快。”

加州大學圣地亞哥分校健康中心的**醫療官Christopher Longhurst博士說，猴痘監測是他所謂的“預見性監測（anticipatory surveillance）”的一個重要**。“廢水中猴痘病毒水平的上升顯然與這種病毒的日益蔓延有關。檢測和監測將有助于在情況變成危機之前提醒我們，為衛生系統和公共機構提供時間來應對、準備和行動。”

圣地亞哥縣公共衛生官員Wilma Wooten同意，“正如我們在COVID-19中看到的那樣，它可以作為一個額外的窗口，了解病毒如何傳播并影響在我們的社區。該縣感謝所有合作伙伴的工作，并期待著我們繼續保持工作關系，以解決對公眾健康的威脅。”

證據和經驗

感染SARS-CoV-2的人甚至在出現COVID-19的癥狀之前就會在他們的糞便中排出這種病毒。這一事實刺激了2020年底**個廢水篩查項目的開展，當時加州大學圣地亞哥分校和加州大學圣地亞哥分校醫院的研究人員開始了一項雄心勃勃的合作，利用自動取樣機器人在整個校園內收集廢水樣本，并進行后續分析。該計劃旨在幫助學生**返回校園。

這些努力的核心是SEARCH（San Diego Epidemiology and Research for COVID Health），這是一個由加州大學圣地亞哥分校、斯克里普斯研究所和圣地亞哥雷迪兒童醫院的科學家組成的聯合體，并與圣地亞哥縣公共衛生官員和其他人合作。

斯克里普斯研究所教授Kristian Andersen博士說，“在過去幾年SEARCH的成功基礎上，看到圣地亞哥這里的廢水監測擴大到也包括猴痘病毒，同時也為未來的人類病原體構建了一個靈活的系統。這項新的研究之所以能夠實現，要感謝加州大學圣地亞哥分校、斯克里普斯研究所和圣地亞哥縣政府之間的緊密合作。”

7月，SEARCH合作者在Nature期刊上發表了一份報告，描述了廢水測序和病毒檢測的成功，并指出該項目在傳統的臨床測試前14天有效地確定了新的“令人關注”的病毒變體，并可可靠地用于預測即將到來的當地感染和病例率的激增（Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05049-6）。

早些時候發表的一項研究估計，廢水監測為加州大學圣地亞哥分校85%的COVIID-19病例提供了早期檢測，從而使緩解和預防工作更加有效（mSystems, 2021, doi:10.1128/mSystems.00793-21）。

研究人員說，他們正在探索將其他病原體加入廢水監測計劃的可能性，包括已經在美國部分地區重新出現的脊髓灰質炎病毒。

Knight實驗室博士后研究員Smruthi Karthikeyan博士說，“在這個過程中增加新的病原體是相當容易的。這是在短時間內可以做到的。我們可以在相同的周轉時間內獲得更多的信息。” （生物谷 Bioon.com）